این آرامگاه در نزدیکی مسجد جامع یزد واقع است . بنای فعلی آرامگاه که اتاق گنبد داری از مدرسه قدیمی سید رکن الدین الدین محمدقاضی عارف و دانشمند قرن هشتم است، بخشی کوچک از یک مجموعه بسیار وسیع شامل مدرسه ، رصدخانه ، کتابخانه ، مسجد بیت الادویه ، دارالشفا و خانقاه است.سیدرکن الدین محمد قاضی که در زمان سلطنت ابو سعید بهادرخان می زیسته ، یکی از شیوخ و حکمای آن زمان بود. او آثار بسیاری از خود به جا گذاشته و صاحب موقوفات فراوان بود.آثار هنری داخل گنبد کلاً از تزئینات وکتیبه هایی است که از رنگ ایجاد کرده اند.