عمارت باشکوه بیگلربیگی میزبان دو موزه تاریخی می باشد.موزه تخصصی پارینه سنگی که به عنوان نخستین موزه پارینه سنگی خاورمیانه شناخته می شود و می توانید مجموعه‌ای از ابزار آلات سنگی و استخوان‌های انسان از دوره‌های پارینه سنگی در ایران و کشورهای دیگر را بیابید. در بخش دیگر عمارت، مجموعه ای از نسخ خطی و اسناد قدیمی متعلق به خانواده بیگلربیگی که روزگاری در این خانه ساکن بودند، به نمایش گذاشته شده است. اتاق های آینه کاری،پنجره های ارسی و مشبک، شیشه های رنگی و اتاق های تو در تو  در کنار حضور نسخ و اسناد قدیمی جذابیت این بخش از موزه را دوچندان نموده است.